Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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