Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNAP02545 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNAP02545 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNAP02545 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNAP02545 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNAP02545 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNAP02545 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNAP02545 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNAP02545 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNAP02545 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNAP02545 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNAP02545 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNAP02545 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNAP02545 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNAP02545 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNAP02545 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNAP02545 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNAP02545 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNAP02545 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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