Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms