Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCATO75600 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCATO75600 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCATO75600 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCATO75600 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCATO75600 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 318.9 ms