Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDB2O43679 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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LDB2O43679 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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LDB2O43679 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDB2O43679 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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LDB2O43679 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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LDB2O43679 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LDB2O43679 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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