Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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HOXA3O43365 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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HOXA3O43365 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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