Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MSI1O43347 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MSI1O43347 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSI1O43347 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSI1O43347 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSI1O43347 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MSI1O43347 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSI1O43347 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSI1O43347 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSI1O43347 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSI1O43347 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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MSI1O43347 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSI1O43347 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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MSI1O43347 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSI1O43347 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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MSI1O43347 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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MSI1O43347 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MSI1O43347 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSI1O43347 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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MSI1O43347 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSI1O43347 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSI1O43347 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSI1O43347 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSI1O43347 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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MSI1O43347 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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MSI1O43347 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MSI1O43347 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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MSI1O43347 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSI1O43347 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSI1O43347 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSI1O43347 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSI1O43347 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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MSI1O43347 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSI1O43347 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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MSI1O43347 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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MSI1O43347 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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MSI1O43347 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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MSI1O43347 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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MSI1O43347 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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