Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLGNO14967 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms