Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms