Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms