Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms