Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CCDC88CQ9P219 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CCDC88CQ9P219 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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CCDC88CQ9P219 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CCDC88CQ9P219 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CCDC88CQ9P219 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CCDC88CQ9P219 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CCDC88CQ9P219 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCDC88CQ9P219 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCDC88CQ9P219 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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