Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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