Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms