Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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