Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms