Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms