Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYT5

KRTAP2-2, Keratin-associated protein 2-2, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-2Q9BYT5 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 ABCC6P1-202ENST00000565118 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AC005154.1-216ENST00000582145 1101 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AC027644.3-201ENST00000607978 557 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AC132216.1-201ENST00000610375 1158 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AL049536.1-202ENST00000623572 455 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 AC027313.1-201ENST00000509159 1666 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
KRTAP2-2Q9BYT5 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP2-2Q9BYT5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP2-2Q9BYT5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP2-2Q9BYT5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms