Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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