Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms