Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms