Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms