Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 NLRC5-203ENST00000436936 6724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms