Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDNQ99608 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDNQ99608 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDNQ99608 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDNQ99608 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDNQ99608 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDNQ99608 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDNQ99608 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDNQ99608 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDNQ99608 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDNQ99608 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDNQ99608 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDNQ99608 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDNQ99608 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDNQ99608 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDNQ99608 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDNQ99608 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDNQ99608 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDNQ99608 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDNQ99608 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDNQ99608 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDNQ99608 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDNQ99608 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDNQ99608 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDNQ99608 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDNQ99608 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDNQ99608 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDNQ99608 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDNQ99608 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDNQ99608 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDNQ99608 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDNQ99608 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDNQ99608 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDNQ99608 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDNQ99608 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDNQ99608 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDNQ99608 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDNQ99608 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDNQ99608 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDNQ99608 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDNQ99608 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDNQ99608 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDNQ99608 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDNQ99608 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDNQ99608 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDNQ99608 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms