Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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NELL2Q99435 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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NELL2Q99435 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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NELL2Q99435 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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NELL2Q99435 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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NELL2Q99435 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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NELL2Q99435 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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NELL2Q99435 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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NELL2Q99435 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELL2Q99435 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms