Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms