Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SPTSSAQ969W0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SPTSSAQ969W0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SPTSSAQ969W0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SPTSSAQ969W0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SPTSSAQ969W0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SPTSSAQ969W0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SPTSSAQ969W0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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