Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms