Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 FER1L5-204ENST00000623019 6477 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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COPS9Q8WXC6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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