Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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