Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF2Q8IX21 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms