Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms