Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms