Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms