Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms