Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A4Q6AI14 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms