Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LRRC38Q5VT99 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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LRRC38Q5VT99 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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LRRC38Q5VT99 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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LRRC38Q5VT99 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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LRRC38Q5VT99 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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LRRC38Q5VT99 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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LRRC38Q5VT99 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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LRRC38Q5VT99 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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LRRC38Q5VT99 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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LRRC38Q5VT99 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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LRRC38Q5VT99 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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LRRC38Q5VT99 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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LRRC38Q5VT99 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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LRRC38Q5VT99 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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