Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PROX2Q3B8N5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PROX2Q3B8N5 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms