Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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