Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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