Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP7Q16576 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms