Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms