Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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DDB1Q16531 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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DDB1Q16531 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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DDB1Q16531 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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DDB1Q16531 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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DDB1Q16531 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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DDB1Q16531 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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DDB1Q16531 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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DDB1Q16531 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
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