Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms