Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD2Q16342 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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