Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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NCOA1Q15788 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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NCOA1Q15788 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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NCOA1Q15788 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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