Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms