Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms