Protein–RNA interactions for Protein: Q15633

TARBP2, RISC-loading complex subunit TARBP2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP2Q15633 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TARBP2Q15633 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 352.7 ms