Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SS18Q15532 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SS18Q15532 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SS18Q15532 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SS18Q15532 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SS18Q15532 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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